В пещере находят обнявшиеся трупы. Судя по портрету, сделанному Анджелой, один из них — Джордж Клуни. Тем временем, из Афганистана прибывает Ханна Берли — новая любовь агента Бута.

Помимо следствия о смерти охотника за преступниками, команде приходится иметь дело с экстравагантным телеведущим, готовым на все, чтобы заполучить Бреннан в свою передачу.

Во время идентификации погибших на перевозившем рабов судне Амелия Роуз, которое затонуло 150 лет назад, найдено тело юноши, убитого недавно. В ходе расследования Буту и Бреннан приходится посетить "круиз пумы", где женщины в возрасте проводят время с молодыми парнями. Тем временем Кэм обнаруживает личную связь с одной из жервт Амелии Роуз, а Свитс понимает, что платонических отношений с Дейзи ему недостаточно

В сгоревшем грузовике найден расплавленный скелет. Расследование приводит Бута и Бреннан в местную школу. Возможно, разгадка кроется в запретной связи между учителем и учеником. Тем временем Ханна пытается наладить отношения с Паркером, а Свитс помогает Дейзи подготовиться к психологическому тестированию

В ходе расследования дела о трупе, найденном в душе, выявляется связь с торговлей поддельными сумками. Тем временем Ходжинс и Анджела принимают важное решение об их дальнейшей семейной жизни, а Бут рассказывает Ханне о чувствах Бреннан к нему.

Тело, замаскированное под чучело, найдено с пулевым ранением в поле. Команде приходится работать очень быстро, чтобы успеть до надвигающегося шторма, который может вызвать потенциальные осложнения и уничтожить улики. Бут и Бреннан опрашивают трех жен жертвы, которые к тому же сестры, и узнают, что ревность между ними и желание внимания со стороны мужа могло послужить раздором в семье. В деле появляется родственник, который неодобрительно относился к многоженству жертвы. Тем временем Кэм неуверенна в отношениях  со своим другом, доктором; но они оба понимают, что должны сделать свои отношения более приоритетными.

В День Святого Валентина в домашнем солярии были обнаружены сожженные останки женщины, работающей свадебным планировщиком. Кэм торопит команду, чтобы успеть отметить праздник со своим парнем.  В то время как «умник» работает безвылазно в лаборатории, Бут и Бреннан опрашивают возможных подозреваемых. Но вскоре они взламывают компьютер жертвы и обнаруживают служебные файлы, которые и приводят их к главному подозреваемому. А между тем и Бут и Бреннан преуменьшают значение Дня Святого Валентина, а Ходжинс пытается запланировать романтичный день для Анджелы.

После недавнего наводнения на границе США и Канады, на берег выносит семь пар расчлененных ног. Но что-то не складывается, когда шесть пар ступней идентифицируются; они принадлежат телам из близлежащих ферм тел университета. Когда канадский судебный ортопед доктор Дуглас Филмор принимает решение отправиться обратно в Канаду, он и Бренанн объединяются, и в соответствии с парами ступней идентифицируют жертву, а редкая и дорогая пара кроссовок приводит команду к убийце жертвы.  А между тем Кэм попадает под горячую воду, когда она строит планы относительно колледжа для дочери за ее спиной.

В дикой местности найдены останки ведущего телешоу «Разрушители мифов». На первый взгляд ведущий стал жертвой мифической Чупакабры – гибрида млекопитающего и рептилии, существование которого так и не было подтверждено наукой. Вскоре команда узнает, что жертва поехала в отдаленный район Западной Вирджинии, чтобы развенчать миф о Чупакабре. Бут и Бреннан опрашивают возможных подозреваемых, включая ведущую конкурирующего канала Дикая Пустошь; криптозоолога и животного экстрасенса. Но когда на месте преступления восстановлена видеопленка, а на теле жертвы находят специфические следы зубов, команда узнает подробности смерти жертвы, которые ставят под сомнения первоначальную, мифическую теорию его смерти. Тем временем, интерн и бывший алкоголик Винсент Найджел-Мюррей возмещает должное каждому члену команды и делает удивительное признание..

Команда идентифицирует останки успешного человека, найденного на территории недавно построенной детской площадки общественного центра. После осмотра дома жертвы и допроса его бывшего партнера и работодателя, Бут и Брэннан обнаруживают, что жертва сожгла все мосты с прошлой жизнью, где было много агрессии и обмана, и стала членом радикальной группы в поддержку честности. Между тем, каждый из членов команды пытается придерживаться честного способа общения, который впрочем, не всегда имеет положительные последствия. А Анджела убеждает Ходжинса противостоять угрожающим фактам ее беременности.

На улице найдена глухонемая 15-летняя девушка по имени Джейн Доу, перепачканная кровью, с ножом в руках. Команда полагает, что девушка ответственна за недавнее убийство. Тем временем Анжела держит Ходжинса в неведении относительно некоторых деталей ее беременности.

В финальной серии сезона команда идентифицирует ужасные останки игрока в боулинг, которые были найдены застрявшими в одном из автоматических пинспоттеров. После того, как дело зашло в тупик, Бут и Бреннан решают под прикрытием найти улики, вступив в соперничающую команду по боулингу.